「put one's affairs in order」は「身辺整理をする」という意味です。
I must put my affairs in order.
私は身辺整理をしなければならない。
He put his affairs in order before seeing her again.
彼は彼女に再会する前に身辺整理をした。
He put his affairs in order before he had the operation.
彼は手術を受ける前に身辺を整理した。
She wanted to put her affairs in order before she died.
彼女は死ぬ前に身辺整理をしたかった。
He put his affairs in order and returned to his hometown.
彼は身辺を整理して故郷へ帰った。